Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF3Q9H094 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF3Q9H094 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF3Q9H094 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms