Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC90BQ9GZT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC90BQ9GZT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms