Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF518BQ9C0D4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF518BQ9C0D4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF518BQ9C0D4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms