Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CIPCQ9C0C6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIPCQ9C0C6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms