Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPEF2Q9C093 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPEF2Q9C093 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SPEF2Q9C093 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPEF2Q9C093 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms