Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM6Q9C030 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM6Q9C030 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM6Q9C030 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM6Q9C030 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms