Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN6Q9BZV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN6Q9BZV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms