Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A5Q9BY07 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms