Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF17Q9BXT8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
RNF17Q9BXT8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RNF17Q9BXT8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms