Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA5Q9BWX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA5Q9BWX5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATA5Q9BWX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms