Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA9Q9BWV2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms