Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP1Q9BWH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPAP1Q9BWH6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP1Q9BWH6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms