Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FNDC11Q9BVV2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC11Q9BVV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms