Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYT17Q9BSW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYT17Q9BSW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT17Q9BSW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT17Q9BSW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms