Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN3Q9BQT9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms