Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA1CQ9BQE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA1CQ9BQE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms