Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLX1AQ9BQ83 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms