Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA0

PCDHB18P, Putative protocadherin beta-18, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB18PQ96TA0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB18PQ96TA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB18PQ96TA0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB18PQ96TA0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms