Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT8L2Q96SF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L2Q96SF2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L2Q96SF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms