Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WRNIP1Q96S55 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WRNIP1Q96S55 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WRNIP1Q96S55 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WRNIP1Q96S55 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms