Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGLYRP2Q96PD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGLYRP2Q96PD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGLYRP2Q96PD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms