Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN5Q96NI6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN5Q96NI6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN5Q96NI6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms