Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOPNLQ96NB1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOPNLQ96NB1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOPNLQ96NB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms