Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC11Q96DB2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC11Q96DB2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms