Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP3Q96CW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms