Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF34Q969K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms