Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HGDQ93099 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HGDQ93099 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HGDQ93099 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HGDQ93099 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HGDQ93099 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HGDQ93099 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HGDQ93099 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HGDQ93099 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HGDQ93099 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HGDQ93099 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HGDQ93099 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HGDQ93099 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HGDQ93099 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HGDQ93099 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HGDQ93099 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HGDQ93099 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HGDQ93099 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HGDQ93099 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HGDQ93099 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HGDQ93099 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HGDQ93099 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HGDQ93099 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HGDQ93099 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HGDQ93099 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HGDQ93099 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HGDQ93099 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HGDQ93099 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HGDQ93099 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms