Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2A3Q93084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms