Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRTOMTQ8WZ04 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRTOMTQ8WZ04 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms