Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY2Q8WXA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY2Q8WXA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY2Q8WXA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms