Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC44A1Q8WWI5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC44A1Q8WWI5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC44A1Q8WWI5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC44A1Q8WWI5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A1Q8WWI5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A1Q8WWI5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A1Q8WWI5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC44A1Q8WWI5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms