Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC12

RDH11, Retinol dehydrogenase 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH11Q8TC12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDH11Q8TC12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDH11Q8TC12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH11Q8TC12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms