Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIRBP-AS1Q8TBR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms