Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGCLL1Q8TB92 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCLL1Q8TB92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLL1Q8TB92 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGCLL1Q8TB92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLL1Q8TB92 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms