Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNL1Q8NG31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KNL1Q8NG31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms