Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF548Q8NEK5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF548Q8NEK5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF548Q8NEK5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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