Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD6BQ8N6M0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms