Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SMIM20Q8N5G0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMIM20Q8N5G0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMIM20Q8N5G0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SMIM20Q8N5G0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SMIM20Q8N5G0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SMIM20Q8N5G0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SMIM20Q8N5G0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SMIM20Q8N5G0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SMIM20Q8N5G0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SMIM20Q8N5G0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM20Q8N5G0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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