Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RYBPQ8N488 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RYBPQ8N488 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms