Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VWDEQ8N2E2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
VWDEQ8N2E2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
VWDEQ8N2E2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms