Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D3Q8IZS8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D3Q8IZS8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms