Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC117Q8IWD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms