Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGDCC3Q8IVU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGDCC3Q8IVU1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGDCC3Q8IVU1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms