Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms