Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD3Q8IVD9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms