Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT12Q8IV01 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT12Q8IV01 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT12Q8IV01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms