Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRX1Q86UT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRX1Q86UT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms