Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NPM2Q86SE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NPM2Q86SE8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms