Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOP1Q7RTM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOP1Q7RTM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOP1Q7RTM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms