Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP50Q70EL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP50Q70EL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP50Q70EL3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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